Badania naukowe | Wydział Biologii

Tematyka badawcza na Wydziale Biologii

Katedra Biochemii Ogólnej i Medycznej

Obszary badań:

Struktura i funkcja białek stresowych:

  • Rola proteaz z rodziny HtrA oraz białek opiekuńczych pochodzenia bakteryjnego w wirulencji bakterii patogennych
  • Struktura i funkcja proteaz HtrA i białek opiekuńczych człowieka oraz ich rola w kancerogenezie i rozwoju innych schorzeń
  • Mechanizm dysocjacji i degradacji białek tworzących agregaty w komórkach bakteryjnych poddanych stresowi – rola małych białek szoku termicznego (sHsps) IbpAB oraz systemu białek opiekuńczych ClpB/DnaK (Hsp100) w dezagregacji białek  i wirulencji bakterii patogennych
  • Mechanizmy regulujące powstawanie bakterii tolerujących antybiotyki
  • Rola proteaz i białek opiekuńczych w przetrwaniu niekorzystnych warunków środowiska i patogenezie bakterii Dickeya solani

PRACOWNIA BIOCHEMII BIAŁEK I KWASÓW NUKLEINOWYCH

Obszary badań:

Struktura i funkcja białek stresowych:

  • Rola proteaz z rodziny HtrA oraz białek opiekuńczych pochodzenia bakteryjnego w wirulencji bakterii patogennych
  • Struktura i funkcja proteaz HtrA i białek opiekuńczych człowieka oraz ich rola w kancerogenezie i rozwoju innych schorzeń
  • Rola proteaz i białek opiekuńczych w przetrwaniu niekorzystnych warunków środowiska i patogenezie bakterii Dickeya solani

PRACOWNIA BIOCHEMII MIKROORGANIZMÓW

Obszary badań:

  • Mechanizm dysocjacji i degradacji białek tworzących agregaty w komórkach bakteryjnych poddanych stresowi – rola małych białek szoku termicznego (sHsps) IbpAB oraz systemu białek opiekuńczych ClpB/DnaK (Hsp100) w dezagregacji białek i wirulencji bakterii patogennych
  • Mechanizmy regulujące powstawanie bakterii tolerujących antybiotyki

 

Katedra Biologii i Genetyki Medycznej
 
Działalność naukowa pracowników koncentruje się na zagadnieniach dotyczących biologii komórek ludzkich oraz chorób uwarunkowanych genetycznie, a w szczególności na:
  • badaniach nad polimorfizmami predysponującymi do chorób cywilizacyjnych
  • komórkowych szlakach sygnalizacyjnych, które ulegają rozregulowaniu w chorobach genetycznych oraz cywilizacyjnych 
  • badaniach aktywności biologicznej związków pochodzenia roślinnego oraz syntetycznych i możliwości ich wykorzystania w prewencji i terapii chorób uwarunkowanych genetycznie, m.in. nowotworów
  • mechanizmach takich procesów komórkowych, jak: autofagia, biogeneza lizosomów, programowana śmierć komórki, starzenie komórkowe
  • badaniach dotyczących  mechanizmów procesu degradacji substratów białkowych związanego z retikulum endoplazmatycznym, transportu białek przez błony retikulum,
  • badaniach nad  mechanizmami ludzkich chorób związanych z nieprawidłowym fałdowaniem i degradacją białek transportowanych do różnych organelli komórkowych lub wydzielanych na zewnątrz komórki
  • poznaniu istoty defektu chorób genetycznych oraz zależności pomiędzy obrazem klinicznym a genotypem choroby
  • profilowaniu ekspresji genów zarówno w chorobach genetycznych jak i cywilizacyjnych
  • ocenie wpływu zaburzeń funkcjonowania lizosomów na parametry układu immunologicznego oraz metabolizm komórki
  • poszukiwaniu nowych biomarkerów w chorobach cywilizacyjnych
  • zastosowaniu zwierzęcych modeli chorób genetycznych w celu poznania molekularnych mechanizmów patogenezy oraz poszukiwania nowych strategii terapeutycznych oraz biomarkerów chorób. 

 

Katedra Biologii Molekularnej
  • Regulacja replikacji DNA chromosomów bakteryjnych, plazmidów i genomów bakteriofagów
  • Kontrola rozwoju wirusów w komórkach gospodarza
  • Bioróżnorodność bakteriofagów
  • Diagnostyka i możliwości zwalczania zakażeń bakteryjnych

 

Katedra Genetyki Molekularnej Bakterii

Zainteresowania naukowe pracowników katedry obejmuje przede wszystkim genetyka i biologia molekularna mikroorganizmów, a w szczególności:

  • Regulacja metabolizmu oraz genetyka mikroorganizmów środowiska morskiego
  • Mechanizmy regulacji replikacji DNA różnych replikonów bakteryjnych i bakteriofagowych
  • Regulacja replikacji DNA w powiązaniu metabolizmem podstawowym oraz stanem fizjologicznym komórki
  • Biologia plazmidów, w tym systemy toksyna-antytoksyna
  • Mechanizmy odpowiedzi bakterii na stany stresu środowiskowego
  • Antybakteryjne właściwości substancji pochodzenia roślinnego, izotiocyjanianów i możliwości ich wykorzystania wobec bakterii patogennych (w tym enterokrwotocznych Escherichia coli)
  • Mechanizmy regulacji ekspresji genów bakteryjnych
  • Biologia i biotechnologia bakteriofagów pochodzących z różnych środowisk

 

Katedra Cytologii i Embriologii Roślin
  • Rozmnażanie płciowe i apomiktyczne roślin kwiatowych
  • Poliploidyzacja w różnicowaniu komórek roślinnych
  • Komunikacja symplastowa w rozwoju roślin
  • Epigenetyczna kontrola rozwoju nasion
  • Indukcja embriogenezy i organogenezy roślin in vitro
  • Kwiatowe struktury wydzielnicze

 

Katedra Ekologii i Zoologii Kręgowców
  • Odpowiedź ekologiczna, fizjologiczna i behawioralna ptaków i ssaków (na poziomie osobniczym, populacyjnym i ekosystemowym) na wielkoskalowe zmiany klimatyczne
  • Biologia, ekologia i behawior siewkowców w okresie migracji na południowym wybrzeżu Bałtyku
  • Funkcjonowanie lądowych i morskich ekosystemów polarnych
  • Znaczenie kolonijnych ptaków rybo- i planktonożernych w ekosystemach morskich i lądowych
  • Ekologia i faunistyka krajowych gatunków nietoperzy i drobnych ssaków naziemnych
  • Znaczenie ekologiczne i ekonomiczne gatunków konfliktowych (kormoran, bóbr) dla funkcjonowania ekosystemów leśnych i wodnych Polski północnej
  • Procesy synurbizacyjne w awifaunie i chiropterofaunie Trójmiasta
  • Fenologia i dynamika migracji ptaków trzcinowisk

 

Katedra Ekologii Roślin
  • Późnoglacjalna i holoceńska historia roślinności, klimatu i wpływu człowieka w północnej Polsce oparta na danych palinologicznych, analizach makroskopowych szczątków roślin oraz geochemii osadów
  • Interdyscyplinarna rekonstrukcja historii przyrodniczej Puszczy Białowieskiej
  • Historia zmian hydrologicznych w południowej strefie Bałtyku
  • Archeobotanika średniowiecznego osadnictwa: użytkowanie roślin, zmiany środowiska przyrodniczego i synantropizacja flory
  • Archeobotanika stanowisk pradziejowych w Afryce Pn i na Bliskim Wschodzie
  • Monitoring współczesnego opadu pyłku – narzędzie do rekonstrukcji historii zmian roślinności i klimatu
  • Biologia i ekologia roślin wodnych
  • Cechy historii życiowych roślin wodnych i ich zastosowanie w ochronie ekosystemów jeziornych
  • Regulatory struktury roślinności w jeziorach
  • Różnorodność funkcjonalna roślin wodnych i zbiorowisk

 

Katedra Ewolucji Molekularnej
  • Ewolucja i filogenetyka molekularna trudnych taksonów pasożytniczych
  • Molekularna filogenetyka, taksonomia oraz genetyka populacyjna roślin
  • Różnorodność biologiczna i genetyczna wirusów w kontekście ewolucyjnym

 

Katedra Fizjologii i Biotechnologii Roślin
  • Regulacja i przebieg cyklu komórkowego glonów DesmodesmusChlamydomonas
  • Adaptacja glonów i roślin wodnych do chemicznych zanieczyszczeń środowiska wodnego
  • Podłoża kondycjonowane glonów i sinic – skład i aktywność biologiczna
  • Tkanka floemowa dyniowatych w produkcji białek rekombinowanych
  • Produkcja wosków i alkoholi tłuszczowych w genetycznie modyfikowanych szczepach Chlamydomonas reinhardtii
 
Katedra Fizjologii Zwierząt i Człowieka

Poznanie neurofizjologicznych i immunologicznych podstaw funkcjonowania ośrodkowego układu nerwowego, w szczególności:

  • Wpływ farmakologicznej/ elektrycznej stymulacji lub lezji struktur mózgowych na aktywność immunologiczną i behawioralną szczurów
  • Zmiany czynności elektrycznej struktur mózgowych u zwierząt w warunkach indukowanej aktywności ośrodkowego układu nerwowego
  • Działanie środków farmakologicznych na wybrane parametry krwi oraz zachowanie apetytywne myszy i szczurów
  • Neuroimmunologiczne i neurobehawioralne mechanizmy reakcji stresowych oraz indywidualnego zróżnicowania podatności na stres
  • Wykorzystanie innowacyjnych materiałów w medycynie regeneracyjnej – badania biokompatybilności
  • Badania behawioralne, fizjologiczne i genetyczne w odniesieniu do dobrostanu zwierząt, również dzikich
  • Zwierzęce modele chorób ośrodkowego układu nerwowego u człowieka
  • Stres i regulacja neurohormonalna
 
Katedra Genetyki i Biosystematyki
  • Ewolucyjne i ekologiczne aspekty genetyki populacji zwierząt, badane z wykorzystaniem technik genetyki molekularnej
  • Filogeografia i taksonomia molekularna
  • Zastosowanie genetyki populacyjnej w ochronie bioróżnorodności. Ocena poziomu różnorodności genetycznej, identyfikacja jednostek ochrony, wspomaganie ustalania priorytetów i tworzenia strategii ochrony bioróżnorodności
  • Badanie relacji mikrobiom – gospodarz u bezkręgowców
  • Badanie molekularnych mechanizmów regulacji ekspresji genów na poziomie transkrypcji u prokaryota
  • Rozpoznanie faunistyczne w regionach i środowiskach słabo zbadanych pod tym względem (m.in. obszary (sub-)tropikalne, (sub-)arktyczne; wody podziemne, okresowo wysychające) oraz szeroko rozumiana pogłębiona systematyka z uwzględnieniem opisów nowych taksonów, ich klasyfikacji, zmienności wewnątrz- i międzygatunkowej, historii ewolucyjnej i powiązań filogenetycznych oraz przystosowań środowiskowych
  • Określenie wpływu czynników środowiskowych na występowanie bezkręgowców wodnych i wykorzystanie kluczowych indykacyjnych taksonów bentonicznych do oceny jakości wód 
  • Rekonstrukcja zmian środowiskowych i klimatycznych w czwartorzędzie na podstawie szczątków Ostracoda  
  • Cechy historii życiowych i sposobu rozmnażania jako komponenty dostosowania i ewolucja cech fenotypowych 
  • Biologia i ekologia skorupiaków z południowego Spitsbergenu
 
Katedra Mikrobiologii
  • Biologia bakteryjnych systemów restrykcyjno-modyfikacyjnych
  • Badania nad rozwojem nowych technologii sekwencjonowania genomowego DNA
  • Badania nad mechanizmami stabilnego dziedziczenia plazmidów w komórkach bakteryjnych
  • Analiza molekularna plazmidów izolowanych z bakterii środowiskowych
  • Biologia fagów termofilnych izolowanych ze środowisk ekstremalnych
  • Charakterystyka tremostabilnych endolizyn
  • Analiza termostabilnych rekombinaz pod kątem ich wykorzystania w diagnostyce molekularnej
  • Analiza metagenomów mikroorganizmów termofilnych
  • Konstrukcja nowych wektorów na potrzeby biotechnologii
  • Badania nad molekularnymi mechanizmami ekspresji genów
 
Katedra Taksonomii Roślin i Ochrony Przyrody
  • Fenetyczna, filogenetyczna i fitogeograficzna analiza rzędu Orchidales wykonana z użyciem danych morfologicznych i anatomicznych oraz metod numerycznych i molekularnych
  • Ewolucja mechanizmów zapylania u storczykowatych na podstawie badań molekularnych, ultrastrukturalnych oraz chemicznych
  • Rewizja taksonomiczna, filogeneza i różnorodność genetyczna wybranych taksonów  grzybów zlichenizowanych i ich fotobiontów na podstawie cech morfologicznych, chemicznych i wybranych markerów genetycznych
  • Aktywność biologiczna wtórnych metabolitów porostowych
  • Relichenizacja w warunkach in vitro
  • Studia florystyczno-ekologiczne porostów na wybranych podłożach
  • Biologia i ekologia ginących i chronionych w Polsce roślin naczyniowych oraz porostów. Badania cech populacji i warunków fitocenotyczno-siedliskowych, analiza zmienności genetycznej, morfologicznej jako podstawy efektywnej ochrony
  • Naturalne zróżnicowanie, dynamika i antropogeniczne przemiany szaty roślinnej Pomorza Gdańskiego
  • Synantropizacja flory
  • Rozmieszczenie i zasoby roślin naczyniowych Pomorza Gdańskiego
  • Badania nad rozwojową i ewolucyjną plastycznością sposobów odżywiania roślin, zarówno w odniesieniu do interakcji z grzybami jak i przemian fizjologicznych zachodzących w roślinach z  wykorzystaniem  metod biologii molekularnej (genomika, transkryptomika), a także metod metabolomicznych oraz izotopowych
 
Katedra Zoologii Bezkręgowców i Parazytologii
  • Biologia, ekologia i taksonomia różnych grup pasożytów
  • Parazytofauna kręgowców i bezkręgowców
  • Diagnostyka parazytologiczna
  • Faunistyka, ekologia, taksonomia, filogenetyka klasyczna i molekularna stawonogów
  • Morfologia funkcjonalna, porównawcza i ewolucyjna stawonogów
  • Ewolucja różnorodności morfologicznej i taksonomicznej owadów
  • Paleobiogeografia i biogeografia historyczna owadów
  • Owady w bursztynie bałtyckim i innych żywicach kopalnych

 

Stacja Badania Wędrówek Ptaków
  • Kompleksowe badania wędrówek ptaków z uwzględnieniem dynamiki sezonowej, biometrii, orientacji i monitoringu liczebności
  • Strategie i trasy migracji ptaków w obrębie europejsko-afrykańskiego systemu wędrówkowego ptaków
  • Behawioralne i ewolucyjne odpowiedzi ptaków wędrownych na globalne zmiany środowiska, w tym na ocieplenie klimatu
  • Plastyczność pierzenia ptaków w odpowiedzi na warunki środowiska i w relacji do wędrówki i innych etapów cyklu życiowego
  • Monitoring długoterminowych zmian morfologicznych u ptaków wędrownych
  • Taksonomiczne, ekologiczne i epidemiologiczne aspekty występowania u ptaków wędrownych chorób i pasożytów z różnych taksonów
 
Stacja Biologiczna
Zaplecze dydaktyczne i naukowe dla jednostek Wydzialu Biologii.
 
 
Pracownia Biologii Molekularnej Instytutu Biochemii i Biofizyki PAN afiliowana przy Uniwersycie Gdańskim
  • Molekularne mechanizmy chorób genetycznych i autoimmunologicznych człowieka oraz możliwości leczenia tych schorzeń
  • egulacja ekspresji genów i replikacji DNA w komórkach prokariotycznych i eukariotycznych
 
 
Treść ostatnio zmodyfikowana przez: Tomasz Kretowicz
Treść wprowadzona przez: Tomasz Kretowicz
Ostatnia modyfikacja: 
poniedziałek, 17 lipca 2017 roku, 14:48