Tematyka badawcza na Wydziale Biologii
Katedra Biochemii Ogólnej i Medycznej
Obszary badań:
Struktura i funkcja białek stresowych:
- Rola proteaz z rodziny HtrA oraz białek opiekuńczych pochodzenia bakteryjnego w wirulencji bakterii patogennych
- Struktura i funkcja proteaz HtrA i białek opiekuńczych człowieka oraz ich rola w kancerogenezie i rozwoju innych schorzeń
- Mechanizm dysocjacji i degradacji białek tworzących agregaty w komórkach bakteryjnych poddanych stresowi – rola małych białek szoku termicznego (sHsps) IbpAB oraz systemu białek opiekuńczych ClpB/DnaK (Hsp100) w dezagregacji białek i wirulencji bakterii patogennych
- Mechanizmy regulujące powstawanie bakterii tolerujących antybiotyki
- Rola proteaz i białek opiekuńczych w przetrwaniu niekorzystnych warunków środowiska i patogenezie bakterii Dickeya solani
PRACOWNIA BIOCHEMII BIAŁEK I KWASÓW NUKLEINOWYCH
Obszary badań:
Struktura i funkcja białek stresowych:
- Rola proteaz z rodziny HtrA oraz białek opiekuńczych pochodzenia bakteryjnego w wirulencji bakterii patogennych
- Struktura i funkcja proteaz HtrA i białek opiekuńczych człowieka oraz ich rola w kancerogenezie i rozwoju innych schorzeń
- Rola proteaz i białek opiekuńczych w przetrwaniu niekorzystnych warunków środowiska i patogenezie bakterii Dickeya solani
PRACOWNIA BIOCHEMII MIKROORGANIZMÓW
Obszary badań:
- Mechanizm dysocjacji i degradacji białek tworzących agregaty w komórkach bakteryjnych poddanych stresowi – rola małych białek szoku termicznego (sHsps) IbpAB oraz systemu białek opiekuńczych ClpB/DnaK (Hsp100) w dezagregacji białek i wirulencji bakterii patogennych
- Mechanizmy regulujące powstawanie bakterii tolerujących antybiotyki
Katedra Biologii i Genetyki Medycznej
- Działalność naukowa pracowników koncentruje się na zagadnieniach dotyczących biologii komórek ludzkich oraz chorób uwarunkowanych genetycznie, a w szczególności na:
-
- badaniach nad polimorfizmami predysponującymi do chorób cywilizacyjnych
- komórkowych szlakach sygnalizacyjnych, które ulegają rozregulowaniu w chorobach genetycznych oraz cywilizacyjnych
- badaniach aktywności biologicznej związków pochodzenia roślinnego oraz syntetycznych i możliwości ich wykorzystania w prewencji i terapii chorób uwarunkowanych genetycznie, m.in. nowotworów
- mechanizmach takich procesów komórkowych, jak: autofagia, biogeneza lizosomów, programowana śmierć komórki, starzenie komórkowe
- badaniach dotyczących mechanizmów procesu degradacji substratów białkowych związanego z retikulum endoplazmatycznym, transportu białek przez błony retikulum,
- badaniach nad mechanizmami ludzkich chorób związanych z nieprawidłowym fałdowaniem i degradacją białek transportowanych do różnych organelli komórkowych lub wydzielanych na zewnątrz komórki
- poznaniu istoty defektu chorób genetycznych oraz zależności pomiędzy obrazem klinicznym a genotypem choroby
- profilowaniu ekspresji genów zarówno w chorobach genetycznych jak i cywilizacyjnych
- ocenie wpływu zaburzeń funkcjonowania lizosomów na parametry układu immunologicznego oraz metabolizm komórki
- poszukiwaniu nowych biomarkerów w chorobach cywilizacyjnych
- zastosowaniu zwierzęcych modeli chorób genetycznych w celu poznania molekularnych mechanizmów patogenezy oraz poszukiwania nowych strategii terapeutycznych oraz biomarkerów chorób.
Katedra Biologii Molekularnej- Regulacja replikacji DNA chromosomów bakteryjnych, plazmidów i genomów bakteriofagów
- Kontrola rozwoju wirusów w komórkach gospodarza
- Bioróżnorodność bakteriofagów
- Diagnostyka i możliwości zwalczania zakażeń bakteryjnych
Katedra Genetyki Molekularnej Bakterii-
Zainteresowania naukowe pracowników katedry obejmuje przede wszystkim genetyka i biologia molekularna mikroorganizmów, a w szczególności:
- Regulacja metabolizmu oraz genetyka mikroorganizmów środowiska morskiego
- Mechanizmy regulacji replikacji DNA różnych replikonów bakteryjnych i bakteriofagowych
- Regulacja replikacji DNA w powiązaniu metabolizmem podstawowym oraz stanem fizjologicznym komórki
- Biologia plazmidów, w tym systemy toksyna-antytoksyna
- Mechanizmy odpowiedzi bakterii na stany stresu środowiskowego
- Antybakteryjne właściwości substancji pochodzenia roślinnego, izotiocyjanianów i możliwości ich wykorzystania wobec bakterii patogennych (w tym enterokrwotocznych Escherichia coli)
- Mechanizmy regulacji ekspresji genów bakteryjnych
- Biologia i biotechnologia bakteriofagów pochodzących z różnych środowisk
-
Katedra Cytologii i Embriologii Roślin-
- Rozmnażanie płciowe i apomiktyczne roślin kwiatowych
- Poliploidyzacja w różnicowaniu komórek roślinnych
- Komunikacja symplastowa w rozwoju roślin
- Epigenetyczna kontrola rozwoju nasion
- Indukcja embriogenezy i organogenezy roślin in vitro
- Kwiatowe struktury wydzielnicze
Katedra Ekologii i Zoologii Kręgowców-
- Odpowiedź ekologiczna, fizjologiczna i behawioralna ptaków i ssaków (na poziomie osobniczym, populacyjnym i ekosystemowym) na wielkoskalowe zmiany klimatyczne
- Biologia, ekologia i behawior siewkowców w okresie migracji na południowym wybrzeżu Bałtyku
- Funkcjonowanie lądowych i morskich ekosystemów polarnych
- Znaczenie kolonijnych ptaków rybo- i planktonożernych w ekosystemach morskich i lądowych
- Ekologia i faunistyka krajowych gatunków nietoperzy i drobnych ssaków naziemnych
- Znaczenie ekologiczne i ekonomiczne gatunków konfliktowych (kormoran, bóbr) dla funkcjonowania ekosystemów leśnych i wodnych Polski północnej
- Procesy synurbizacyjne w awifaunie i chiropterofaunie Trójmiasta
- Fenologia i dynamika migracji ptaków trzcinowisk
Katedra Ekologii Roślin-
- Późnoglacjalna i holoceńska historia roślinności, klimatu i wpływu człowieka w północnej Polsce oparta na danych palinologicznych, analizach makroskopowych szczątków roślin oraz geochemii osadów
- Interdyscyplinarna rekonstrukcja historii przyrodniczej Puszczy Białowieskiej
- Historia zmian hydrologicznych w południowej strefie Bałtyku
- Archeobotanika średniowiecznego osadnictwa: użytkowanie roślin, zmiany środowiska przyrodniczego i synantropizacja flory
- Archeobotanika stanowisk pradziejowych w Afryce Pn i na Bliskim Wschodzie
- Monitoring współczesnego opadu pyłku – narzędzie do rekonstrukcji historii zmian roślinności i klimatu
- Biologia i ekologia roślin wodnych
- Cechy historii życiowych roślin wodnych i ich zastosowanie w ochronie ekosystemów jeziornych
- Regulatory struktury roślinności w jeziorach
- Różnorodność funkcjonalna roślin wodnych i zbiorowisk
Katedra Ewolucji Molekularnej- Ewolucja i filogenetyka molekularna trudnych taksonów pasożytniczych
- Molekularna filogenetyka, taksonomia oraz genetyka populacyjna roślin
- Różnorodność biologiczna i genetyczna wirusów w kontekście ewolucyjnym
Katedra Fizjologii i Biotechnologii Roślin-
- Regulacja i przebieg cyklu komórkowego glonów Desmodesmus i Chlamydomonas
- Adaptacja glonów i roślin wodnych do chemicznych zanieczyszczeń środowiska wodnego
- Podłoża kondycjonowane glonów i sinic – skład i aktywność biologiczna
- Tkanka floemowa dyniowatych w produkcji białek rekombinowanych
- Produkcja wosków i alkoholi tłuszczowych w genetycznie modyfikowanych szczepach Chlamydomonas reinhardtii
Katedra Fizjologii Zwierząt i Człowieka-
Poznanie neurofizjologicznych i immunologicznych podstaw funkcjonowania ośrodkowego układu nerwowego, w szczególności:
- Wpływ farmakologicznej/ elektrycznej stymulacji lub lezji struktur mózgowych na aktywność immunologiczną i behawioralną szczurów
- Zmiany czynności elektrycznej struktur mózgowych u zwierząt w warunkach indukowanej aktywności ośrodkowego układu nerwowego
- Działanie środków farmakologicznych na wybrane parametry krwi oraz zachowanie apetytywne myszy i szczurów
- Neuroimmunologiczne i neurobehawioralne mechanizmy reakcji stresowych oraz indywidualnego zróżnicowania podatności na stres
- Wykorzystanie innowacyjnych materiałów w medycynie regeneracyjnej – badania biokompatybilności
- Badania behawioralne, fizjologiczne i genetyczne w odniesieniu do dobrostanu zwierząt, również dzikich
- Zwierzęce modele chorób ośrodkowego układu nerwowego u człowieka
- Stres i regulacja neurohormonalna
Katedra Genetyki i Biosystematyki-
- Ewolucyjne i ekologiczne aspekty genetyki populacji zwierząt, badane z wykorzystaniem technik genetyki molekularnej
- Filogeografia i taksonomia molekularna
- Zastosowanie genetyki populacyjnej w ochronie bioróżnorodności. Ocena poziomu różnorodności genetycznej, identyfikacja jednostek ochrony, wspomaganie ustalania priorytetów i tworzenia strategii ochrony bioróżnorodności
- Badanie relacji mikrobiom – gospodarz u bezkręgowców
- Badanie molekularnych mechanizmów regulacji ekspresji genów na poziomie transkrypcji u prokaryota
- Rozpoznanie faunistyczne w regionach i środowiskach słabo zbadanych pod tym względem (m.in. obszary (sub-)tropikalne, (sub-)arktyczne; wody podziemne, okresowo wysychające) oraz szeroko rozumiana pogłębiona systematyka z uwzględnieniem opisów nowych taksonów, ich klasyfikacji, zmienności wewnątrz- i międzygatunkowej, historii ewolucyjnej i powiązań filogenetycznych oraz przystosowań środowiskowych
- Określenie wpływu czynników środowiskowych na występowanie bezkręgowców wodnych i wykorzystanie kluczowych indykacyjnych taksonów bentonicznych do oceny jakości wód
- Rekonstrukcja zmian środowiskowych i klimatycznych w czwartorzędzie na podstawie szczątków Ostracoda
- Cechy historii życiowych i sposobu rozmnażania jako komponenty dostosowania i ewolucja cech fenotypowych
- Biologia i ekologia skorupiaków z południowego Spitsbergenu
Katedra Mikrobiologii-
- Biologia bakteryjnych systemów restrykcyjno-modyfikacyjnych
- Badania nad rozwojem nowych technologii sekwencjonowania genomowego DNA
- Badania nad mechanizmami stabilnego dziedziczenia plazmidów w komórkach bakteryjnych
- Analiza molekularna plazmidów izolowanych z bakterii środowiskowych
- Biologia fagów termofilnych izolowanych ze środowisk ekstremalnych
- Charakterystyka tremostabilnych endolizyn
- Analiza termostabilnych rekombinaz pod kątem ich wykorzystania w diagnostyce molekularnej
- Analiza metagenomów mikroorganizmów termofilnych
- Konstrukcja nowych wektorów na potrzeby biotechnologii
- Badania nad molekularnymi mechanizmami ekspresji genów
Katedra Taksonomii Roślin i Ochrony Przyrody-
- Fenetyczna, filogenetyczna i fitogeograficzna analiza rzędu Orchidales wykonana z użyciem danych morfologicznych i anatomicznych oraz metod numerycznych i molekularnych
- Ewolucja mechanizmów zapylania u storczykowatych na podstawie badań molekularnych, ultrastrukturalnych oraz chemicznych
- Rewizja taksonomiczna, filogeneza i różnorodność genetyczna wybranych taksonów grzybów zlichenizowanych i ich fotobiontów na podstawie cech morfologicznych, chemicznych i wybranych markerów genetycznych
- Aktywność biologiczna wtórnych metabolitów porostowych
- Relichenizacja w warunkach in vitro
- Studia florystyczno-ekologiczne porostów na wybranych podłożach
- Biologia i ekologia ginących i chronionych w Polsce roślin naczyniowych oraz porostów. Badania cech populacji i warunków fitocenotyczno-siedliskowych, analiza zmienności genetycznej, morfologicznej jako podstawy efektywnej ochrony
- Naturalne zróżnicowanie, dynamika i antropogeniczne przemiany szaty roślinnej Pomorza Gdańskiego
- Synantropizacja flory
- Rozmieszczenie i zasoby roślin naczyniowych Pomorza Gdańskiego
- Badania nad rozwojową i ewolucyjną plastycznością sposobów odżywiania roślin, zarówno w odniesieniu do interakcji z grzybami jak i przemian fizjologicznych zachodzących w roślinach z wykorzystaniem metod biologii molekularnej (genomika, transkryptomika), a także metod metabolomicznych oraz izotopowych
Katedra Zoologii Bezkręgowców i Parazytologii-
- Biologia, ekologia i taksonomia różnych grup pasożytów
- Parazytofauna kręgowców i bezkręgowców
- Diagnostyka parazytologiczna
- Faunistyka, ekologia, taksonomia, filogenetyka klasyczna i molekularna stawonogów
- Morfologia funkcjonalna, porównawcza i ewolucyjna stawonogów
- Ewolucja różnorodności morfologicznej i taksonomicznej owadów
- Paleobiogeografia i biogeografia historyczna owadów
- Owady w bursztynie bałtyckim i innych żywicach kopalnych
Stacja Badania Wędrówek Ptaków-
- Kompleksowe badania wędrówek ptaków z uwzględnieniem dynamiki sezonowej, biometrii, orientacji i monitoringu liczebności
- Strategie i trasy migracji ptaków w obrębie europejsko-afrykańskiego systemu wędrówkowego ptaków
- Behawioralne i ewolucyjne odpowiedzi ptaków wędrownych na globalne zmiany środowiska, w tym na ocieplenie klimatu
- Plastyczność pierzenia ptaków w odpowiedzi na warunki środowiska i w relacji do wędrówki i innych etapów cyklu życiowego
- Monitoring długoterminowych zmian morfologicznych u ptaków wędrownych
- Taksonomiczne, ekologiczne i epidemiologiczne aspekty występowania u ptaków wędrownych chorób i pasożytów z różnych taksonów
Stacja Biologiczna- Zaplecze dydaktyczne i naukowe dla jednostek Wydzialu Biologii.
Pracownia Biologii Molekularnej Instytutu Biochemii i Biofizyki PAN afiliowana przy Uniwersycie Gdańskim-
- Molekularne mechanizmy chorób genetycznych i autoimmunologicznych człowieka oraz możliwości leczenia tych schorzeń
- egulacja ekspresji genów i replikacji DNA w komórkach prokariotycznych i eukariotycznych